Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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