Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Nprl3-202ENSMUST00000109389 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 9530059O14Rik-204ENSMUST00000215759 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Mrps23-202ENSMUST00000107915 332 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Gm11919-201ENSMUST00000117609 721 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Gm13898-201ENSMUST00000141865 610 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Mok-204ENSMUST00000177224 551 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 D130017N08Rik-201ENSMUST00000180460 510 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Gm29548-201ENSMUST00000187012 694 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Gm28809-201ENSMUST00000187542 782 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Gm28105-201ENSMUST00000187788 694 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Gm31763-201ENSMUST00000217788 673 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 AC127583.1-201ENSMUST00000224351 540 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Gm9869-201ENSMUST00000063858 375 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Klf10-203ENSMUST00000227920 2144 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Gng2-203ENSMUST00000159073 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Gm26532-201ENSMUST00000180630 690 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Gm29595-202ENSMUST00000187954 466 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 AC114645.2-201ENSMUST00000214308 791 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 3830406C13Rik-213ENSMUST00000225294 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Gm11437-201ENSMUST00000050771 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc83-201ENSMUST00000040413 1546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Gm4925-202ENSMUST00000168843 1561 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Gm13071-201ENSMUST00000122237 376 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ubxn2bQ0KL01 Gm6038-201ENSMUST00000154310 948 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
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