Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms