Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Cnbd1-201ENSMUST00000137780 1331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Gm16337-201ENSMUST00000160368 917 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Rpp30-201ENSMUST00000025714 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 mt-Nd3-201ENSMUST00000082411 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Pdlim5-204ENSMUST00000168967 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 AC158595.1-201ENSMUST00000217989 1435 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 AC158388.1-201ENSMUST00000225441 256 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nme2Q01768 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms