Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Rbp4Q00724 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms