Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AlkP97793 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
AlkP97793 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AlkP97793 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AlkP97793 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AlkP97793 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AlkP97793 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AlkP97793 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AlkP97793 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AlkP97793 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AlkP97793 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AlkP97793 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AlkP97793 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
AlkP97793 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AlkP97793 4930524O07Rik-202ENSMUST00000162334 293 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AlkP97793 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
AlkP97793 BC025446-202ENSMUST00000185307 758 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AlkP97793 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AlkP97793 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AlkP97793 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AlkP97793 Rhoc-205ENSMUST00000196817 877 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AlkP97793 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AlkP97793 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
AlkP97793 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AlkP97793 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AlkP97793 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AlkP97793 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AlkP97793 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AlkP97793 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AlkP97793 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AlkP97793 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AlkP97793 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AlkP97793 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AlkP97793 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AlkP97793 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AlkP97793 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AlkP97793 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AlkP97793 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AlkP97793 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
AlkP97793 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AlkP97793 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AlkP97793 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AlkP97793 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AlkP97793 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AlkP97793 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AlkP97793 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AlkP97793 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AlkP97793 Gm22388-201ENSMUST00000158194 248 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
AlkP97793 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
AlkP97793 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AlkP97793 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
AlkP97793 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
AlkP97793 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AlkP97793 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AlkP97793 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AlkP97793 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AlkP97793 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AlkP97793 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AlkP97793 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AlkP97793 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AlkP97793 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AlkP97793 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AlkP97793 Ptpn2-202ENSMUST00000120934 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AlkP97793 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AlkP97793 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AlkP97793 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AlkP97793 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AlkP97793 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AlkP97793 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AlkP97793 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AlkP97793 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AlkP97793 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AlkP97793 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AlkP97793 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AlkP97793 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AlkP97793 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AlkP97793 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AlkP97793 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AlkP97793 1700025C18Rik-201ENSMUST00000109304 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AlkP97793 Gm8019-201ENSMUST00000119317 587 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
AlkP97793 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AlkP97793 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AlkP97793 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AlkP97793 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AlkP97793 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AlkP97793 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AlkP97793 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AlkP97793 Olfr1313-201ENSMUST00000099599 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AlkP97793 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AlkP97793 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AlkP97793 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
AlkP97793 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AlkP97793 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AlkP97793 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AlkP97793 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
AlkP97793 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AlkP97793 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
AlkP97793 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
AlkP97793 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AlkP97793 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms