Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgcdP82347 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgcdP82347 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgcdP82347 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Tmem56-207ENSMUST00000155309 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgcdP82347 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgcdP82347 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcdP82347 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcdP82347 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcdP82347 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcdP82347 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcdP82347 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcdP82347 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
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