Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Gm13437-201ENSMUST00000122434 1981 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Irx1P81068 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Gm28581-201ENSMUST00000186086 2177 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Igsf6-201ENSMUST00000047194 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Irx1P81068 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Irx1P81068 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Irx1P81068 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Irx1P81068 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Irx1P81068 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Gm7598-201ENSMUST00000130251 3123 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Irx1P81068 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Irx1P81068 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Kalrn-203ENSMUST00000114947 2922 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Irx1P81068 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Irx1P81068 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Irx1P81068 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Irx1P81068 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
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