Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

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Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx3P81067 AC160562.2-201ENSMUST00000216374 2201 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx3P81067 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx3P81067 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx3P81067 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx3P81067 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx3P81067 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Gm21039-201ENSMUST00000223359 2012 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irx3P81067 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irx3P81067 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irx3P81067 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irx3P81067 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Kalrn-203ENSMUST00000114947 2922 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irx3P81067 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irx3P81067 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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