Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hoxd13P70217 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
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