Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3P62908 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3P62908 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3P62908 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3P62908 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3P62908 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3P62908 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3P62908 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps3P62908 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps3P62908 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps3P62908 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps3P62908 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms