Protein–RNA interactions for Protein: P58391

Kcnn3, Small conductance calcium-activated potassium channel protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnn3P58391 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Txnrd1-201ENSMUST00000020484 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcnn3P58391 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms