Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf5P56477 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf5P56477 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Asb11-201ENSMUST00000033755 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Irf5P56477 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf5P56477 4930551O13Rik-201ENSMUST00000145585 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Irf5P56477 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Irf5P56477 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf5P56477 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Vmn1r192-201ENSMUST00000072632 1067 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Irf5P56477 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Irf5P56477 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Irf5P56477 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Irf5P56477 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Irf5P56477 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Irf5P56477 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Irf5P56477 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Irf5P56477 Olfr1434-203ENSMUST00000208197 1229 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf5P56477 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf5P56477 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf5P56477 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf5P56477 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf5P56477 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Olfr1447-201ENSMUST00000071484 1113 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Irf5P56477 Olfr1446-201ENSMUST00000081236 1044 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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