Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Ndufb2-205ENSMUST00000135671 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Gm43288-201ENSMUST00000197594 2628 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Prr30-201ENSMUST00000057718 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Mrps14-203ENSMUST00000135680 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Akap1-203ENSMUST00000107904 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 2310065F04Rik-201ENSMUST00000125538 2724 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Gm45354-201ENSMUST00000199820 2557 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Idua-202ENSMUST00000112563 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
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