Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 AC102312.1-202ENSMUST00000218600 851 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Gm5040-201ENSMUST00000218609 800 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 AC102523.1-201ENSMUST00000228706 1144 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Olfr1329-201ENSMUST00000071979 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Klk1b26-201ENSMUST00000048945 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Sh3gl2-202ENSMUST00000107184 671 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Gm14152-201ENSMUST00000127020 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Mir1941-201ENSMUST00000157834 83 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Gm4778-202ENSMUST00000159517 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Ppp1r2-ps1-201ENSMUST00000178232 621 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 n-R5s105-201ENSMUST00000178499 119 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 n-R5s149-201ENSMUST00000178520 119 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 n-R5s103-201ENSMUST00000178755 119 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 n-R5s123-201ENSMUST00000178804 119 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 n-R5s142-201ENSMUST00000178820 119 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 n-R5s144-201ENSMUST00000178859 119 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 n-R5s139-201ENSMUST00000178975 119 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 n-R5s136-201ENSMUST00000179080 119 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 n-R5s113-201ENSMUST00000179143 119 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Ppp1r2-ps6-201ENSMUST00000179333 621 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 n-R5s117-201ENSMUST00000179431 119 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 n-R5s138-201ENSMUST00000179476 119 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 n-R5s122-201ENSMUST00000179500 119 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 n-R5s143-201ENSMUST00000179542 119 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 n-R5s107-201ENSMUST00000179704 119 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Gm26391-201ENSMUST00000179843 119 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 n-R5s110-201ENSMUST00000179995 119 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 n-R5s128-201ENSMUST00000180096 119 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 n-R5s124-201ENSMUST00000180334 119 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Gm44658-201ENSMUST00000207965 637 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Gm36172-201ENSMUST00000219852 723 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Gm18621-201ENSMUST00000222677 679 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 AC125409.3-201ENSMUST00000223488 653 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 CT030035.1-201ENSMUST00000223964 935 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.2 ms