Protein–RNA interactions for Protein: P49935

Ctsh, Pro-cathepsin H, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtshP49935 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtshP49935 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtshP49935 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtshP49935 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtshP49935 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtshP49935 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtshP49935 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtshP49935 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtshP49935 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtshP49935 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtshP49935 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CtshP49935 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtshP49935 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtshP49935 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtshP49935 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtshP49935 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtshP49935 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtshP49935 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtshP49935 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CtshP49935 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CtshP49935 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtshP49935 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtshP49935 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CtshP49935 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtshP49935 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtshP49935 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtshP49935 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtshP49935 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtshP49935 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtshP49935 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtshP49935 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtshP49935 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtshP49935 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtshP49935 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtshP49935 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtshP49935 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtshP49935 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtshP49935 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtshP49935 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtshP49935 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtshP49935 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtshP49935 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtshP49935 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtshP49935 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtshP49935 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtshP49935 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CtshP49935 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtshP49935 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtshP49935 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtshP49935 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtshP49935 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtshP49935 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtshP49935 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtshP49935 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CtshP49935 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtshP49935 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtshP49935 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtshP49935 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CtshP49935 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtshP49935 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CtshP49935 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtshP49935 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CtshP49935 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtshP49935 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtshP49935 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CtshP49935 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtshP49935 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtshP49935 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtshP49935 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtshP49935 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtshP49935 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtshP49935 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtshP49935 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtshP49935 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtshP49935 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtshP49935 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtshP49935 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtshP49935 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtshP49935 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtshP49935 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CtshP49935 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CtshP49935 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtshP49935 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtshP49935 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtshP49935 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtshP49935 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtshP49935 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CtshP49935 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtshP49935 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtshP49935 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtshP49935 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtshP49935 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CtshP49935 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtshP49935 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtshP49935 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtshP49935 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtshP49935 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtshP49935 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CtshP49935 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CtshP49935 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms