Protein–RNA interactions for Protein: P48540

Gdnf, Glial cell line-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GdnfP48540 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
GdnfP48540 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
GdnfP48540 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
GdnfP48540 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
GdnfP48540 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Gm37641-201ENSMUST00000193837 239 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
GdnfP48540 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
GdnfP48540 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
GdnfP48540 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Gm43435-201ENSMUST00000199996 1438 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
GdnfP48540 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
GdnfP48540 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms