Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Gbx2P48031 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gbx2P48031 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms