Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Tnfsf9P41274 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Tnfsf9P41274 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf9P41274 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms