Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pola1P33609 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pola1P33609 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pola1P33609 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pola1P33609 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pola1P33609 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pola1P33609 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pola1P33609 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pola1P33609 AC124752.1-201ENSMUST00000222131 776 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pola1P33609 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms