Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.58□□□□□ -0.71
Hoxc5P32043 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxc5P32043 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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