Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Gm18690-201ENSMUST00000204488 985 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Gm44706-201ENSMUST00000206822 815 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Gm44969-201ENSMUST00000207829 549 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Gm19137-201ENSMUST00000213790 1164 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Olfr170-203ENSMUST00000218837 1008 ntAPPRIS P2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 AC154738.2-201ENSMUST00000227403 1110 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Olfr170-201ENSMUST00000078603 1008 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Gm4778-201ENSMUST00000098878 1098 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 1110015O18Rik-202ENSMUST00000183944 1533 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Gm28771-202ENSMUST00000189399 1499 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Gm11480-201ENSMUST00000120214 659 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Gm15878-201ENSMUST00000127561 306 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Vmn1r-ps53-201ENSMUST00000173066 922 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Gm26715-201ENSMUST00000181676 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Gm28619-201ENSMUST00000185889 622 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Gm28426-201ENSMUST00000187385 620 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Gm2707-201ENSMUST00000188979 714 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Gm43556-201ENSMUST00000196186 681 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 AC140409.4-201ENSMUST00000215757 538 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Tbca-204ENSMUST00000220825 497 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 AC123658.1-201ENSMUST00000228364 867 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 AC154838.3-201ENSMUST00000228876 965 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Ssmem1-202ENSMUST00000031798 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Gm45793-201ENSMUST00000207900 1342 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Hoxa2P31245 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Il1f9-201ENSMUST00000057567 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxa2P31245 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms