Protein–RNA interactions for Protein: P29268

Ctgf, Connective tissue growth factor, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtgfP29268 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CtgfP29268 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CtgfP29268 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CtgfP29268 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CtgfP29268 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CtgfP29268 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CtgfP29268 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CtgfP29268 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CtgfP29268 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CtgfP29268 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CtgfP29268 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CtgfP29268 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CtgfP29268 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CtgfP29268 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtgfP29268 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtgfP29268 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtgfP29268 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtgfP29268 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CtgfP29268 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtgfP29268 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtgfP29268 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CtgfP29268 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CtgfP29268 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CtgfP29268 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CtgfP29268 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms