Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

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Length 674 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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