Protein–RNA interactions for Protein: P28033

Cebpb, CCAAT/enhancer-binding protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpbP28033 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CebpbP28033 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CebpbP28033 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
CebpbP28033 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CebpbP28033 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CebpbP28033 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CebpbP28033 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CebpbP28033 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CebpbP28033 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms