Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ms4a2P20490 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a2P20490 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a2P20490 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a2P20490 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a2P20490 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a2P20490 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a2P20490 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a2P20490 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a2P20490 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a2P20490 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a2P20490 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a2P20490 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a2P20490 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a2P20490 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a2P20490 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a2P20490 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a2P20490 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a2P20490 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a2P20490 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a2P20490 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a2P20490 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a2P20490 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a2P20490 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a2P20490 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a2P20490 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a2P20490 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a2P20490 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a2P20490 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a2P20490 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a2P20490 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a2P20490 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a2P20490 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a2P20490 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a2P20490 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a2P20490 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a2P20490 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a2P20490 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a2P20490 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a2P20490 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a2P20490 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a2P20490 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a2P20490 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a2P20490 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ms4a2P20490 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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