Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

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Length 672 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkcaP20444 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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