Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Pard3-201ENSMUST00000026921 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Gm16576-201ENSMUST00000128342 5404 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Ndufb2-205ENSMUST00000135671 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Ccdc136-202ENSMUST00000115275 3279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Dmtn-203ENSMUST00000110984 4176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ntf3P20181 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ntf3P20181 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ntf3P20181 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Ntf3P20181 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Ntf3P20181 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ntf3P20181 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ntf3P20181 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ntf3P20181 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ntf3P20181 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ntf3P20181 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Ntf3P20181 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ntf3P20181 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ntf3P20181 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ntf3P20181 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Ntf3P20181 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ntf3P20181 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Ntf3P20181 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Ntf3P20181 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Ntf3P20181 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ntf3P20181 Trem1-201ENSMUST00000048782 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ntf3P20181 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ntf3P20181 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Ntf3P20181 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ntf3P20181 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ntf3P20181 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ntf3P20181 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ntf3P20181 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ntf3P20181 Als2-201ENSMUST00000027178 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ntf3P20181 Slc25a44-204ENSMUST00000195657 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ntf3P20181 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ntf3P20181 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ntf3P20181 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ntf3P20181 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ntf3P20181 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ntf3P20181 Pdpk1-202ENSMUST00000102927 7161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ntf3P20181 Ano1-202ENSMUST00000118556 4566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ntf3P20181 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ntf3P20181 Gm26822-201ENSMUST00000181732 3374 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ntf3P20181 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ntf3P20181 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ntf3P20181 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ntf3P20181 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ntf3P20181 Gm28635-201ENSMUST00000189772 4734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ntf3P20181 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ntf3P20181 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ntf3P20181 Tsix-202ENSMUST00000211291 3263 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ntf3P20181 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ntf3P20181 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ntf3P20181 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ntf3P20181 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ntf3P20181 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ntf3P20181 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ntf3P20181 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ntf3P20181 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ntf3P20181 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ntf3P20181 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ntf3P20181 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ntf3P20181 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ntf3P20181 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ntf3P20181 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ntf3P20181 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ntf3P20181 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ntf3P20181 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ntf3P20181 Nlgn3-201ENSMUST00000065858 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ntf3P20181 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ntf3P20181 Gm26527-201ENSMUST00000180416 1948 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ntf3P20181 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ntf3P20181 Gm26690-201ENSMUST00000181457 1997 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ntf3P20181 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ntf3P20181 Gm43307-201ENSMUST00000199465 2371 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ntf3P20181 Olfr222-202ENSMUST00000214351 2474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ntf3P20181 Vipas39-202ENSMUST00000072744 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ntf3P20181 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ntf3P20181 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ntf3P20181 Cdh1-203ENSMUST00000167688 3203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ntf3P20181 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ntf3P20181 Itgad-204ENSMUST00000177111 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ntf3P20181 Ehmt1-205ENSMUST00000114432 4539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms