Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Gm14542-201ENSMUST00000118460 1248 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PdgfaP20033 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms