Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 St5-203ENSMUST00000084738 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Gm37084-201ENSMUST00000191688 5898 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Gm16478-201ENSMUST00000208113 5084 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Sardh-202ENSMUST00000102886 4521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Slc12a6-204ENSMUST00000110991 4556 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Trip11-201ENSMUST00000021605 9873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Abcg1-201ENSMUST00000024829 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Pex7-201ENSMUST00000020182 8099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Csn1s1P19228 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Csn1s1P19228 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Sptan1-205ENSMUST00000113719 8018 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Fam71e2-202ENSMUST00000174409 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Tln2-207ENSMUST00000215784 8330 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Aebp1-202ENSMUST00000109829 2541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Gm26865-201ENSMUST00000180970 3284 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Rhobtb1-201ENSMUST00000020101 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Syne1-201ENSMUST00000041639 6990 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Csn1s1P19228 Olfr410-202ENSMUST00000213831 5070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms