Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Gm12372-201ENSMUST00000121654 768 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm16337-201ENSMUST00000160368 917 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm37857-201ENSMUST00000191784 1199 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm18660-201ENSMUST00000199542 629 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Tas2r104-201ENSMUST00000072404 909 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Cnbd1-201ENSMUST00000137780 1331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 5730460C07Rik-201ENSMUST00000081193 1834 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Smgc-203ENSMUST00000109276 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm1330-202ENSMUST00000109942 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm8185-201ENSMUST00000160999 669 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm18164-201ENSMUST00000213769 927 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm18166-201ENSMUST00000215557 927 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 AC153529.1-201ENSMUST00000217818 370 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Hesx1-202ENSMUST00000224331 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 AC158388.1-201ENSMUST00000225441 256 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 4930447F04Rik-201ENSMUST00000033525 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 A430018G15Rik-201ENSMUST00000124210 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Gm28359-201ENSMUST00000187470 1322 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hoxb1P17919 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms