Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Zfp780b-201ENSMUST00000081618 3004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Adcy7-204ENSMUST00000171456 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Sorbs1-201ENSMUST00000099466 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Grpr-201ENSMUST00000033730 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Casz1-201ENSMUST00000094464 4349 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Pml-201ENSMUST00000085673 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Ctc1-201ENSMUST00000021278 4164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Phf20-201ENSMUST00000037401 5737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Npas4-201ENSMUST00000056129 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Rdh9-201ENSMUST00000052652 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Unc13d-209ENSMUST00000174822 3337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Tm4sf1-201ENSMUST00000029376 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Shroom2-202ENSMUST00000101141 7494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Cfb-201ENSMUST00000025229 2737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Ldb3-205ENSMUST00000090040 4981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Pcdhgc5-201ENSMUST00000055935 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Prdm1-204ENSMUST00000218369 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Zfhx2-201ENSMUST00000036328 10397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Prr30-201ENSMUST00000057718 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Eya3-213ENSMUST00000180250 5020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm37307-201ENSMUST00000193663 2621 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Olfr169-204ENSMUST00000216070 2328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Tmem30c-203ENSMUST00000120112 3478 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Epb41l5-202ENSMUST00000052404 6442 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm42608-201ENSMUST00000197563 2018 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Rnh1-201ENSMUST00000106033 2091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Trak1-211ENSMUST00000211187 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Gm16070-201ENSMUST00000127328 5210 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Col6a5-201ENSMUST00000165165 8046 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Cacna1c-214ENSMUST00000188106 6462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Plec-202ENSMUST00000054449 15018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Arfgap3-201ENSMUST00000067215 2619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Vpreb1P13372 Olfr731-203ENSMUST00000214152 5572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms