Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Gm6517-201ENSMUST00000121056 511 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
DmdP11531 Gm13898-201ENSMUST00000141865 610 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
DmdP11531 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
DmdP11531 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
DmdP11531 Gm42208-201ENSMUST00000198215 670 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
DmdP11531 AC153153.1-201ENSMUST00000225803 793 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
DmdP11531 Gm16477-201ENSMUST00000085365 801 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
DmdP11531 Gm17415-201ENSMUST00000096427 789 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
DmdP11531 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
DmdP11531 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
DmdP11531 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
DmdP11531 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
DmdP11531 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
DmdP11531 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
DmdP11531 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
DmdP11531 Gm23908-201ENSMUST00000104599 132 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
DmdP11531 Gm6276-201ENSMUST00000120159 579 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
DmdP11531 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
DmdP11531 Gm15258-201ENSMUST00000153801 741 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
DmdP11531 Gm26698-201ENSMUST00000181290 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
DmdP11531 Ift22-204ENSMUST00000200153 670 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
DmdP11531 Gm32772-203ENSMUST00000207022 675 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
DmdP11531 Hamp2-203ENSMUST00000217812 437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
DmdP11531 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
DmdP11531 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
DmdP11531 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
DmdP11531 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
DmdP11531 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
DmdP11531 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
DmdP11531 Uspl1-202ENSMUST00000100410 3148 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
DmdP11531 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
DmdP11531 Gm21963-201ENSMUST00000179519 330 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
DmdP11531 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
DmdP11531 Clec1b-201ENSMUST00000032262 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
DmdP11531 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
DmdP11531 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
DmdP11531 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
DmdP11531 Gm28453-201ENSMUST00000185556 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
DmdP11531 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
DmdP11531 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
DmdP11531 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
DmdP11531 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
DmdP11531 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
DmdP11531 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
DmdP11531 Prss23os-203ENSMUST00000208814 975 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
DmdP11531 Prss23os-204ENSMUST00000209064 972 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
DmdP11531 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
DmdP11531 Nsmce2-201ENSMUST00000079703 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
DmdP11531 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
DmdP11531 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
DmdP11531 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
DmdP11531 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
DmdP11531 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
DmdP11531 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
DmdP11531 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
DmdP11531 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
DmdP11531 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
DmdP11531 Fhl1-206ENSMUST00000116596 1203 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
DmdP11531 2010204K13Rik-203ENSMUST00000150671 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
DmdP11531 Gm43103-201ENSMUST00000199021 802 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
DmdP11531 4933407I05Rik-202ENSMUST00000213467 420 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
DmdP11531 Olfr115-201ENSMUST00000076936 939 ntAPPRIS P2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
DmdP11531 Iyd-201ENSMUST00000019896 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
DmdP11531 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
DmdP11531 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
DmdP11531 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
DmdP11531 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
DmdP11531 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
DmdP11531 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
DmdP11531 Gm11685-201ENSMUST00000141559 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
DmdP11531 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
DmdP11531 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
DmdP11531 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
DmdP11531 Gm5766-202ENSMUST00000161633 799 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
DmdP11531 Gm44017-201ENSMUST00000203231 740 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
DmdP11531 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
DmdP11531 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
DmdP11531 Gm9790-201ENSMUST00000054148 288 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
DmdP11531 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
DmdP11531 Gm45663-201ENSMUST00000210429 1632 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
DmdP11531 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
DmdP11531 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
DmdP11531 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
DmdP11531 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
DmdP11531 Rab38-201ENSMUST00000107256 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
DmdP11531 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
DmdP11531 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
DmdP11531 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
DmdP11531 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
DmdP11531 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
DmdP11531 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
DmdP11531 1700026D11Rik-205ENSMUST00000151417 789 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
DmdP11531 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
DmdP11531 Gm42493-201ENSMUST00000197559 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
DmdP11531 Gm44658-201ENSMUST00000207965 637 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
DmdP11531 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
DmdP11531 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
DmdP11531 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
DmdP11531 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
DmdP11531 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms