Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
TtrP07309 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
TtrP07309 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
TtrP07309 Ano1-202ENSMUST00000118556 4566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
TtrP07309 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
TtrP07309 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
TtrP07309 Dusp16-201ENSMUST00000100857 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
TtrP07309 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC8.25□□□□□ -1.09
TtrP07309 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
TtrP07309 Cspg4-201ENSMUST00000035661 8121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
TtrP07309 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
TtrP07309 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
TtrP07309 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
TtrP07309 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
TtrP07309 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC8.25□□□□□ -1.09
TtrP07309 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
TtrP07309 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
TtrP07309 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
TtrP07309 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
TtrP07309 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
TtrP07309 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
TtrP07309 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
TtrP07309 Oas3-201ENSMUST00000044833 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
TtrP07309 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
TtrP07309 Plec-215ENSMUST00000169108 14853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
TtrP07309 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
TtrP07309 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
TtrP07309 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
TtrP07309 Aebp2-201ENSMUST00000032359 5932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
TtrP07309 Myo9a-206ENSMUST00000136740 12252 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
TtrP07309 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
TtrP07309 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
TtrP07309 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
TtrP07309 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
TtrP07309 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
TtrP07309 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
TtrP07309 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
TtrP07309 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
TtrP07309 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
TtrP07309 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
TtrP07309 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
TtrP07309 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
TtrP07309 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
TtrP07309 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC8.25□□□□□ -1.09
TtrP07309 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
TtrP07309 Ccdc40-201ENSMUST00000035935 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
TtrP07309 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
TtrP07309 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
TtrP07309 Btbd7-206ENSMUST00000223554 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
TtrP07309 Lct-201ENSMUST00000073490 6174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
TtrP07309 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
TtrP07309 Plxdc2-201ENSMUST00000028081 6947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
TtrP07309 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
TtrP07309 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
TtrP07309 Tmc3-201ENSMUST00000039317 6221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
TtrP07309 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
TtrP07309 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
TtrP07309 Rbm27-201ENSMUST00000046972 6134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
TtrP07309 Lrrk1-201ENSMUST00000015277 7465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
TtrP07309 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
TtrP07309 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
TtrP07309 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
TtrP07309 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
TtrP07309 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
TtrP07309 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
TtrP07309 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
TtrP07309 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
TtrP07309 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
TtrP07309 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
TtrP07309 Alms1-201ENSMUST00000072018 9986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
TtrP07309 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
TtrP07309 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
TtrP07309 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
TtrP07309 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
TtrP07309 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
TtrP07309 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
TtrP07309 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
TtrP07309 Rassf2-201ENSMUST00000028814 8233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
TtrP07309 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
TtrP07309 Smarcc2-201ENSMUST00000026433 4533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
TtrP07309 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
TtrP07309 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
TtrP07309 Wdr62-201ENSMUST00000108190 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
TtrP07309 Cacna1c-214ENSMUST00000188106 6462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
TtrP07309 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
TtrP07309 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
TtrP07309 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
TtrP07309 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
TtrP07309 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
TtrP07309 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
TtrP07309 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
TtrP07309 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
TtrP07309 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
TtrP07309 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
TtrP07309 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
TtrP07309 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
TtrP07309 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
TtrP07309 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
TtrP07309 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
TtrP07309 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms