Protein–RNA interactions for Protein: P06335

T-cell receptor gamma chain C region 5/10-13, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06335 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06335 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06335 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P06335 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06335 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06335 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06335 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06335 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06335 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06335 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P06335 Olfr1219-204ENSMUST00000215225 5865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06335 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06335 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06335 Greb1l-201ENSMUST00000048977 8414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06335 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06335 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06335 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06335 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P06335 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P06335 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06335 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P06335 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06335 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06335 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P06335 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P06335 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P06335 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P06335 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06335 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P06335 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06335 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P06335 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06335 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06335 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06335 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06335 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06335 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06335 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06335 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06335 Jarid2-208ENSMUST00000173246 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06335 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06335 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06335 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06335 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P06335 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06335 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06335 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06335 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06335 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06335 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06335 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06335 Nol8-209ENSMUST00000223467 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P06335 Ciapin1-209ENSMUST00000162538 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P06335 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P06335 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P06335 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P06335 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P06335 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P06335 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P06335 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P06335 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P06335 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P06335 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P06335 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P06335 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P06335 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P06335 Shank2-205ENSMUST00000146006 7666 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P06335 Son-201ENSMUST00000114036 7945 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P06335 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P06335 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P06335 Rassf2-201ENSMUST00000028814 8233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P06335 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P06335 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
P06335 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
P06335 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P06335 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P06335 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
P06335 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P06335 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P06335 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P06335 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P06335 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P06335 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
P06335 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P06335 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P06335 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
P06335 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P06335 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P06335 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
P06335 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P06335 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P06335 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P06335 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P06335 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P06335 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P06335 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P06335 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P06335 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P06335 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P06335 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.4 ms