Protein–RNA interactions for Protein: P01679

Ig kappa chain V-VI region J539, mousemouse

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01679 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01679 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01679 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01679 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01679 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01679 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P01679 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01679 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01679 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01679 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01679 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01679 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01679 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P01679 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01679 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01679 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01679 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01679 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01679 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01679 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01679 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P01679 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01679 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01679 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01679 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P01679 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01679 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01679 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01679 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P01679 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01679 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01679 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P01679 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01679 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01679 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P01679 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P01679 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01679 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
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P01679 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01679 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01679 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01679 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01679 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01679 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01679 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01679 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01679 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01679 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01679 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01679 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01679 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01679 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01679 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01679 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01679 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01679 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P01679 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01679 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01679 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01679 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01679 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01679 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01679 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01679 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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P01679 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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P01679 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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P01679 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P01679 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01679 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01679 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01679 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01679 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01679 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01679 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01679 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01679 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01679 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01679 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01679 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01679 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01679 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01679 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01679 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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