Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hps1O08983 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hps1O08983 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hps1O08983 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hps1O08983 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hps1O08983 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hps1O08983 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hps1O08983 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Vmn1r184-207ENSMUST00000228369 6361 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hps1O08983 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hps1O08983 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hps1O08983 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Spen-202ENSMUST00000105786 12299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hps1O08983 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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