Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm8888J3QPX5 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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