Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

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Length 637 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Tmem200cJ3QK46 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Tmem200cJ3QK46 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Tmem200cJ3QK46 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Tmem200cJ3QK46 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Tmem200cJ3QK46 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Tmem200cJ3QK46 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Tmem200cJ3QK46 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Tmem200cJ3QK46 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Tmem200cJ3QK46 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Tmem200cJ3QK46 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
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Tmem200cJ3QK46 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem200cJ3QK46 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Tmem200cJ3QK46 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Tmem200cJ3QK46 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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