Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Gm17555F6U8B9 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Gm17555F6U8B9 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Gm17555F6U8B9 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Gm17555F6U8B9 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Gm17555F6U8B9 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17555F6U8B9 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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