Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Gm14148-201ENSMUST00000122433 1008 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 3010001F23Rik-201ENSMUST00000130625 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 Gm4462-201ENSMUST00000166453 492 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 Tmem242-202ENSMUST00000185896 780 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 Gm8226-201ENSMUST00000190511 798 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 Gm38233-201ENSMUST00000194259 807 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 Myo1h-207ENSMUST00000196676 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 AC154477.1-201ENSMUST00000226515 773 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 AC137842.2-201ENSMUST00000227734 797 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 Gm12716-201ENSMUST00000120606 1354 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 Gm17836-201ENSMUST00000191976 1302 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 Gm12676-201ENSMUST00000149078 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 Gm7833-201ENSMUST00000183288 990 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 AC133517.1-201ENSMUST00000225825 594 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 Gemin8-203ENSMUST00000096252 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 5031425E22Rik-202ENSMUST00000185943 1477 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 Efna1-203ENSMUST00000118860 1403 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 Ighv1-5-201ENSMUST00000103494 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 Gm24140-201ENSMUST00000122773 326 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
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Myo5cE9Q1F5 Mir6973a-201ENSMUST00000183646 78 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 AC124613.1-201ENSMUST00000198711 88 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 Rarres2-203ENSMUST00000204182 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Myo5cE9Q1F5 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Myo5cE9Q1F5 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Myo5cE9Q1F5 Ppt1-204ENSMUST00000121870 986 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
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Myo5cE9Q1F5 Mir8111-201ENSMUST00000184463 137 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 5033404E19Rik-202ENSMUST00000194748 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 Ighv1-70-201ENSMUST00000196509 351 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 Olfr1335-202ENSMUST00000219094 1148 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 Gm8796-201ENSMUST00000219122 936 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 AC116797.2-202ENSMUST00000223587 1017 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 Sectm1b-202ENSMUST00000081499 1222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 Olfr1335-201ENSMUST00000084313 1148 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 Nrf1-201ENSMUST00000004761 1589 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Myo5cE9Q1F5 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.9 ms