Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usf3B2RUQ2 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usf3B2RUQ2 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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