Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms