Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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