Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
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