Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nphp1Q9QY53 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms