Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm45481-201ENSMUST00000209717 877 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Gm3791-201ENSMUST00000220790 768 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 AC154477.1-201ENSMUST00000226515 773 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 AC137842.2-201ENSMUST00000227734 797 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
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Col5a3Q9JLI2 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Col5a3Q9JLI2 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Gm16322-202ENSMUST00000141275 700 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Col5a3Q9JLI2 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 5033404E19Rik-202ENSMUST00000194748 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Gm29918-201ENSMUST00000205635 138 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 AC102523.1-201ENSMUST00000228706 1144 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
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Col5a3Q9JLI2 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Ano4-202ENSMUST00000181976 1410 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Gm26818-201ENSMUST00000181367 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Col5a3Q9JLI2 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Col5a3Q9JLI2 3110039M20Rik-201ENSMUST00000127041 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Gm12916-201ENSMUST00000139012 948 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Mc5r-201ENSMUST00000172148 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Col5a3Q9JLI2 Prss1-201ENSMUST00000031910 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Sectm1b-202ENSMUST00000081499 1222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Srp14-201ENSMUST00000009693 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Tprkb-204ENSMUST00000113752 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Gm8094-201ENSMUST00000165136 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Col5a3Q9JLI2 Rab11a-204ENSMUST00000167569 726 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Col5a3Q9JLI2 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
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