Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Chrac1Q9JKP8 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.9 ms