Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Mok-204ENSMUST00000177224 551 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20568-201ENSMUST00000197129 208 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5278-201ENSMUST00000055957 552 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr160-202ENSMUST00000211952 3492 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8094-201ENSMUST00000165136 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8968-201ENSMUST00000199133 1303 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14148-201ENSMUST00000122433 1008 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16441-201ENSMUST00000138176 924 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6038-201ENSMUST00000154310 948 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Gm17944-201ENSMUST00000186351 643 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 1700088E04Rik-207ENSMUST00000188562 631 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9619-201ENSMUST00000211587 762 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Map7-203ENSMUST00000213312 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26818-201ENSMUST00000181367 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Lime1-202ENSMUST00000108804 960 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr874-201ENSMUST00000115004 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28415-201ENSMUST00000187528 452 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Gm38349-201ENSMUST00000195732 462 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Ascl3-201ENSMUST00000035372 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13954-201ENSMUST00000123441 543 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5860-201ENSMUST00000137810 1028 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Gm25394-201ENSMUST00000157338 133 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Tmod3-205ENSMUST00000215821 898 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 AC125409.3-201ENSMUST00000223488 653 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 AC129217.1-201ENSMUST00000225181 642 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Gemin8-203ENSMUST00000096252 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr527-201ENSMUST00000172230 978 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 1700019D03Rik-207ENSMUST00000191441 638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43106-201ENSMUST00000199485 637 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Gm4032-203ENSMUST00000211600 531 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 AC122840.4-201ENSMUST00000221310 1285 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 AC134860.2-201ENSMUST00000225277 1036 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 AC141884.2-201ENSMUST00000228811 775 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Atp5s-204ENSMUST00000220916 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rb1cc1Q9ESK9 5031425E22Rik-202ENSMUST00000185943 1477 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms