Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ube3bQ9ES34 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ube3bQ9ES34 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ube3bQ9ES34 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ube3bQ9ES34 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ube3bQ9ES34 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ube3bQ9ES34 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ube3bQ9ES34 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ube3bQ9ES34 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ube3bQ9ES34 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ube3bQ9ES34 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ube3bQ9ES34 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ube3bQ9ES34 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ube3bQ9ES34 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ube3bQ9ES34 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ube3bQ9ES34 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ube3bQ9ES34 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ube3bQ9ES34 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ube3bQ9ES34 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ube3bQ9ES34 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ube3bQ9ES34 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ube3bQ9ES34 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ube3bQ9ES34 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ube3bQ9ES34 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ube3bQ9ES34 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ube3bQ9ES34 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ube3bQ9ES34 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ube3bQ9ES34 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ube3bQ9ES34 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ube3bQ9ES34 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ube3bQ9ES34 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ube3bQ9ES34 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ube3bQ9ES34 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ube3bQ9ES34 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ube3bQ9ES34 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ube3bQ9ES34 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ube3bQ9ES34 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ube3bQ9ES34 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ube3bQ9ES34 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ube3bQ9ES34 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube3bQ9ES34 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube3bQ9ES34 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube3bQ9ES34 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube3bQ9ES34 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube3bQ9ES34 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube3bQ9ES34 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube3bQ9ES34 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube3bQ9ES34 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube3bQ9ES34 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube3bQ9ES34 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube3bQ9ES34 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube3bQ9ES34 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube3bQ9ES34 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube3bQ9ES34 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube3bQ9ES34 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube3bQ9ES34 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube3bQ9ES34 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube3bQ9ES34 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube3bQ9ES34 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube3bQ9ES34 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube3bQ9ES34 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Ube3bQ9ES34 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube3bQ9ES34 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Ube3bQ9ES34 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube3bQ9ES34 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube3bQ9ES34 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube3bQ9ES34 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube3bQ9ES34 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube3bQ9ES34 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube3bQ9ES34 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube3bQ9ES34 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube3bQ9ES34 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube3bQ9ES34 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube3bQ9ES34 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube3bQ9ES34 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube3bQ9ES34 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube3bQ9ES34 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube3bQ9ES34 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube3bQ9ES34 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube3bQ9ES34 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube3bQ9ES34 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube3bQ9ES34 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube3bQ9ES34 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube3bQ9ES34 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube3bQ9ES34 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube3bQ9ES34 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube3bQ9ES34 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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